继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。
演员：谢尔盖·吉列夫 玛丽娜·沃罗齐什切娃 Вильма Кутавичюте Евгений Санников Анна Завтур 罗斯蒂斯拉夫·贝谢尔 费奥多费多托夫 玛莎·玛修尔 费奥多尔·费多托夫 Софья Аржаных
热度：8393°C
演员：凯莉·库柯 索瑞·安达斯鲁 阿兰娜·乌巴赫 莎朗·斯通 切瑞·海恩斯 佐莎·马梅特 罗茜·佩雷兹 桑地亚哥·卡布瑞拉 T·R·奈特 杰茜·恩尼斯 考莉·埃尔南德斯 德尼·阿克代尼兹 赵牡丹 莫·麦克雷 梅·马丁 雅莎·杰克逊 约瑟夫·朱利安·索里亚 奥黛丽·格蕾丝·马歇尔 格里芬·马修 库尔杜普·科罗塔纳
热度：5889°C